文獻解讀 | 小鼠組織中巨噬細胞的整合蛋白質組學和轉錄組學景觀
2022年11月30日，復旦大學中山醫(yī)院生命科學學院基因工程國家重點實驗室Chen Ding團隊在《Nature Communications》上發(fā)表題為“Integrated proteomic and transcriptomic landscape of macrophages in mouse tissues”的文章，提供了不同組織中巨噬細胞群體的蛋白質組和轉錄組數(shù)據(jù)。
在這篇文章中，云克隆試劑盒【干擾素γ(IFNg)檢測試劑盒(酶聯(lián)免疫吸附試驗法)，SEA049Mu】受到科研工作者的認可，榮登優(yōu)秀國際期刊。
巨噬細胞參與組織內穩(wěn)態(tài)，對先天免疫反應至關重要，但不同組織中不同的巨噬細胞群體表現(xiàn)出不同的基因表達模式和生物過程。雖然已經報道了組織特異性巨噬細胞表觀基因組和轉錄組譜，但不同巨噬細胞種群的蛋白質組仍然很不確定。巨噬細胞異質性的表觀基因組和轉錄組學研究的新證據(jù)普遍證明了環(huán)境效應對組織駐留巨噬細胞特化的重要性。因此，有必要對巨噬細胞蛋白質組的異質性進行分析。
在這項研究中，作者使用質譜和bulk RNA測序分別評估了來自小鼠組織、骨髓來源的巨噬細胞和細胞系RAW264.7的10個原代巨噬細胞群體的蛋白質組和轉錄組模式。結果顯示組織駐留和募集的巨噬細胞之間存在不同的蛋白質組學景觀和蛋白質拷貝數(shù)。分層調控網絡的構建發(fā)現(xiàn)巨噬細胞的細胞型特異性轉錄因子是單個巨噬細胞亞群的組織和功能特性的樞紐。最后，IL18被驗證為區(qū)分肺和肝臟中組織駐留和募集巨噬細胞之間的分子特征和細胞功能特征所必需的。
綜上所述，作者的研究提供了不同組織中巨噬細胞群體的蛋白質組和轉錄組數(shù)據(jù)。這一豐富的資源不僅揭示了不同巨噬細胞群體的功能多樣性，還可以作為未來巨噬細胞生物學研究的起點，從而更好地了解全身巨噬細胞的免疫相關和非免疫相關功能。
